GWAS phân tích họ gen Auxin/Indoleacetic Acid (Aux/IAA) trong cây mía đa bội thể (Saccharum spontaneum)

 GWAS phân tích họ gen Auxin/Indoleacetic Acid (Aux/IAA) trong cây mía đa bội thể (Saccharum spontaneum)

Nguồn: Xiaojin Huang, Munsif Ali Shad, Yazhou Shu, Sikun Nong, Xianlong Li, Songguo Wu, Juan Yang, Muhammad Junaid Rao, Muhammad Zeshan Aslam, Xiaoti Huang, Dige Huang, Lingqiang Wang. 2024. Phân tích toàn bộ bộ gen của họ gen Auxin/Indoleacetic Acid (AUX/IAA) trong mía tự bội (Saccharum spontaneum). Int J Mol Sci.; 2024 Tháng Bảy 8; 25(13):7473. doi: 10.3390/IJMS25137473.

Trừu tượng

Họ auxin / indoleacetic acid (AUX / IAA) đóng vai trò trung tâm trong việc điều chỉnh biểu hiện gen trong quá trình truyền tín hiệu auxin. Tuy nhiên, kiến thức về họ gen này trong cây mía còn hạn chế. Trong nghiên cứu này, 92 thành viên của gia đình IAA đã được xác định trong Saccharum spontaneum, phân bố trên 32 nhiễm sắc thể và được phân loại thành ba cụm dựa trên phát sinh loài và thành phần motif. Các sự kiện sao chép và tái tổ hợp phân đoạn đã góp phần lớn vào sự mở rộng của siêu họ này. Ngoài ra, các yếu tố tác động cis trong các chất thúc đẩy SsIAA liên quan đến điều hòa hormone thực vật và phản ứng căng thẳng đã được dự đoán. Dữ liệu phiên mã cho thấy hầu hết các biểu hiện SsIAA cao hơn đáng kể ở thân và phần cơ bản của lá, và vào ban đêm, cho thấy những gen này có thể tham gia vào quá trình vận chuyển đường. Các xét nghiệm QRT-PCR xác nhận rằng stress lạnh và muối gây ra đáng kể bốn và năm SsIAA, tương ứng. Nội địa hóa dưới tế bào GFP cho thấy SsIAA23 và SsIAA12a được định vị trong nhân, phù hợp với kết quả phân tích tin sinh học. Tóm lại, ở một mức độ nhất định, sự dư thừa chức năng của các thành viên trong gia đình do sự mở rộng của họ gen IAA mía có liên quan đến khả năng chống stress và tái sinh mía như một loại cây trồng lâu năm. Nghiên cứu này cho thấy sự tiến hóa gen và chức năng của họ gen SsIAA trong cây mía, đặt nền tảng cho nghiên cứu sâu hơn về phương thức hoạt động của nó.

 

Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39000581/

 

Hình: Phân bố các thành viên trong học gen IAA của hệ gen cây mía  Saccharum spontaneum.

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Nghiên cứu genomics đầu tiên về gián phân giảm nhiễm trong cây mía đường

Image
 Nghiên cứu genomics đầu tiên về gián phân giảm nhiễm trong cây mía đường Nguồn:  Nina Reis Soares ,  Zirlane Portugal Costa ,  João Paulo Rodrigues Marques ,  Olivier Garsmeur ,  Monalisa Sampaio Carneiro ,  Cláudia Barros Monteiro Vitorello ,  Angélique D'Hont ,  Maria Lucia Carneiro Vieira . 2024. First investigation into the genetic control of meiosis in sugarcane. Plant J.; 2024 Jun; 118(6):2094-2107. doi: 10.1111/tpj.16731.   Mía đường ( Saccharum  spp.) có genome vô cùng phức tạp. Giống mía cải tiến mới, biểu hiện bản chất đa bội thể và đa bội lệch (aneuploid), bởi kết quả lai giữa  Saccharum officinarum  với  S. spontaneum . Rất ít nghiên cứu được tiến hành để xem xét sự phân bào giảm nhiễm (meiotic control) trong loài thực vật đa bội thể, ngoại trừ locus  Ph1  của lúa mì mang gen  ZIP4  ( TaZIP4-B2 ) gen này thúc đẩy sự bắt cặp giữa các nhiễm sắc thể tương đồng (homologous chromo...
Read more

Những hiểu biết mới về di truyền mới có thể dẫn đến việc tạo ra cây bông chống chịu hạn

Những hiểu biết mới về di truyền mới có thể dẫn đến việc tạo ra cây bông chống chịu hạn Cây bông gắn bó chặt chẽ với cuộc sống hàng ngày của chúng ta, từ những chiếc áo phông mềm mại, quần jean thoải mái đến những bộ ga trải giường ấm áp. Đây là loại sợi dệt có khả năng tái tạo hàng đầu trên thế giới và là xương sống của một ngành công nghiệp toàn cầu trị giá hàng tỷ đô la. Khi biến đổi khí hậu gia tăng, những người trồng bông đang đối mặt với những thách thức ngày càng tăng từ hạn hán đến sự nóng lên của trái đất. Tuy nhiên, nghiên cứu mới mang đến hy vọng phát triển các giống bông chịu hạn tốt hơn, có thể duy trì năng suất cao ngay cả trong điều kiện thiếu nước. Trong một nghiên cứu được công bố gần đây trên Tạp chí Công nghệ Sinh học Thực vật, một nhóm nghiên cứu liên ngành đã kiểm tra cách thức mà các loại cây bông khác nhau đáp ứng với hạn hán ở mức độ di truyền. Họ đã trồng 22 giống bông vùng cao ( Gossypium hirsutum  L.) ở khu vực sa mạc thấp của Arizona, với một nử...
Read more